Sehingga April 1436, tahun ke-18 pemerintahan Sejong Agung, Jwauijeong dan Uuijeong masing-masing secara serentak bertugas sebagai Panijosa (判 吏 曹 事) dan Panbyeongjosa (判 兵曹), sehinggakan mereka mengatur urusan kepegawaian yangban (bangsawan sastera dan ketenteraan).

Yeonguijeong terus wujud sebagai jawatan kehormat, dan hanya menilik dan menyesuaikan dokumen diplomatik atau memeriksa kembali kes orang yang dihukum.

Namun, ketika Hwang Hui dilantik sebagai "Yeonguijeong busa" pada tahun yang sama, raja mengubah sistem pemerintahan untuk memperkuat kekuatan Samjeongseung daripada sistem berpusat Yukjo (Enam Kementerian). Dengan pembaharuan itu, Sejong menyatakan bahawa situasi tiga penasihat kanan tertinggi tidak dapat mengambil bahagian dalam urusan negeri bertentangan dengan niat asal untuk menjadikan mereka sebagai anggota dewan tinggi negara.[4]

Semasa pembaharuan, Yukjo berunding dengan Uijeongbu mengenai tanggungjawab setiap menteri. Uijeongbu membincangkan kesahihan permasalahan tersebut, dan kemudian melaporkan kepada raja. Setelah mendapat persetujuan daripada raja, Uijeongbu kembali ke Yujo pula untuk membuat urusan yang ditugaskan. Hasilnya, Yeonguijeong mengambil bahagian dengan lebih aktif dalam pekerjaan perwakilan sebagai ketua Uijeongbu. Walau bagaimanapun, tugas menteri lain, seperti hak Ijo (吏 曹; Kementerian Personel[11]) dan Byeongjo (兵曹, Kementerian Hal Ehwal Tentera[12]) untuk melaksanakan pengurusan personel, pergerakan tentera oleh Byeongjo, dan hak Hyeongjo (刑 刑, Kementerian Hukuman[13]) untuk menangani semua penjenayah selain orang yang dihukum, masih dikendalikan secara langsung oleh menteri terkait.[4]

Ketika Putera Suyang merebut tempat anakanda saudaranya, Raja Danjong, fungsi Yeonguijeong diturunkan ke posisi yang hampir tidak berkuasa seperti sebelumnya. Ini disebabkan ketika Raja Sejo itu masih menjadi putera, tindakannya sangat dibatasi oleh saingan politiknya, Yeonguijeong, Hwangbo In (皇甫 仁) dan Jwauijeong, Kim Jongseo (金宗瑞). Oleh itu, semasa pemerintahan Raja Seongjong dan Jungjong, ada beberapa cadangan untuk mengembalikan kuasa bekas Uijeongbu, tetapi cadangan itu tidak dilaksanakan.[4]

Urusan utama negara dibincangkan ketika Bibyeonsa ditubuhkan pada tahun 1558 (pada tahun ke-10 pemerintahan Raja Myeongjong). Ketiga-tiga orang Ahli Majlis Tinggi menghadiri mesyuarat hanya sebagai "Dojejo" (Pesuruhjaya Tertinggi[14][15]). Oleh itu, kekuatan Yeonguijeong cenderung meningkat atau menurun, bergantung pada suasana politik pada zaman itu, seperti tahap kekuasaan raja, hubungan antara Uijeongbu dan Yukjo, penubuhan Bibyeonsa (備 邊 司; Perintah Pertahanan Sempadan[16]), pentadbiran Kyujanggak (Perpustakaan Diraja) yang terkemudian, konflik antara parti politik, dan kemajuan "pemerintahan mentua" (勢 道 政治, Sedo jeongchi[17]). Walau apa pun, gelaran "Yeonguijeong" terus menjadi puncak dalam sistem birokrasi sepanjang tempoh Joseon.[4]